Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl13P47963 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl13P47963 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms