Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl5P47962 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms