Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic1P46684 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms