Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f2P43135 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms