Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms