Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ThpoP40226 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms