Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf2P39429 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf2P39429 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms