Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab17P35292 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms