Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab21P35282 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms