Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab6aP35279 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms