Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3dP35276 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms