Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stfa3P35173 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms