Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2aP34056 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tfap2aP34056 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms