Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms