Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms