Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd3P30282 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnd3P30282 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnd3P30282 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnd3P30282 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnd3P30282 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd3P30282 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd3P30282 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd3P30282 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms