Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VtnP29788 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VtnP29788 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VtnP29788 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VtnP29788 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VtnP29788 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms