Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms