Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk11bP24788 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms