Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms