Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Csn1s1P19228 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Csn1s1P19228 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms