Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata1P17679 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms