Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptbp1P17225 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptbp1P17225 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms