Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms