Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms