Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms