Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtrP07309 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TtrP07309 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TtrP07309 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtrP07309 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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