Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms