Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06323 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06323 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06323 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06323 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
P06323 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P06323 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P06323 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06323 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06323 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06323 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06323 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P06323 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms