Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B2mP01887 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B2mP01887 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B2mP01887 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B2mP01887 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B2mP01887 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
B2mP01887 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B2mP01887 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B2mP01887 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B2mP01887 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B2mP01887 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B2mP01887 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B2mP01887 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B2mP01887 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B2mP01887 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms