Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01804 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01804 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01804 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01804 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01804 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01804 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01804 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01804 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P01804 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01804 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01804 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms