Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01635 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01635 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01635 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01635 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01635 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01635 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
P01635 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01635 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01635 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01635 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01635 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
P01635 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01635 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01635 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01635 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms