Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igk-V19-17P01633 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms