Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casp8O89110 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casp8O89110 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casp8O89110 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casp8O89110 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casp8O89110 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms