Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops6O88545 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms