Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtssO70370 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtssO70370 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtssO70370 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtssO70370 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CtssO70370 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtssO70370 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtssO70370 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CtssO70370 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms