Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb2O55029 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb2O55029 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb2O55029 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms