Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbrO54799 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbrO54799 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms