Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc1a6O35544 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms