Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms