Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn9O35239 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptpn9O35239 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptpn9O35239 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptpn9O35239 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptpn9O35239 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms