Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms