Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih2O35089 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih2O35089 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms