Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms