Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfil3O08750 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfil3O08750 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms