Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec22bO08547 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms