Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17078M0QW51 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms