Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp955bL7N232 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms