Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms