Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms